28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2631 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  97.11 
 
 
899 aa  1802    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  42.95 
 
 
910 aa  683    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  42.29 
 
 
888 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  100 
 
 
899 aa  1847    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  40.22 
 
 
881 aa  598  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  38.73 
 
 
893 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  33.15 
 
 
878 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  31.8 
 
 
901 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  30.14 
 
 
846 aa  338  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  39.17 
 
 
832 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  37.79 
 
 
820 aa  300  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  28.87 
 
 
892 aa  296  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  29.68 
 
 
862 aa  293  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  36.08 
 
 
815 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  37.24 
 
 
844 aa  283  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  32.9 
 
 
890 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  29.48 
 
 
679 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  29.34 
 
 
674 aa  251  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  27.56 
 
 
835 aa  198  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  23.59 
 
 
938 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  26.85 
 
 
714 aa  125  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  25.12 
 
 
726 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  26.35 
 
 
714 aa  124  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  26.35 
 
 
714 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  25.86 
 
 
714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  26.76 
 
 
743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  26.11 
 
 
714 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  37.27 
 
 
185 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>