18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2359 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  83.98 
 
 		 177 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2001  hypothetical protein  58.5 
 
 		 183 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3299  hypothetical protein  57.82 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2396  hypothetical protein  57.82 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  57.82 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3727  hypothetical protein  49.01 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  40.15 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  36.09 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  32.41 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  29.52 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  29.52 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  29.92 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  31.01 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>