21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0765 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  393  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  79.07 
 
 
190 aa  292  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  53.76 
 
 
203 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  36.57 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  36.62 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  39.85 
 
 
154 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  35.62 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 
149 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  33.83 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  31.11 
 
 
138 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  29.73 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  27.48 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  32.22 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  28.8 
 
 
267 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  33.77 
 
 
127 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  32.97 
 
 
132 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  32.22 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3522  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  21.8 
 
 
116 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>