22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2145 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2145  AmiS/UreI transporter  100 
 
 		 170 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0314  AmiS/UreI transporter  54.82 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3570  AmiS/UreI transporter  51.2 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1308  AmiS/UreI transporter  49.4 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.958044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0308  AmiS/UreI transporter  51.5 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0689938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0322  Urea transporter  35.5 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000124071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1843  AmiS/UreI transporter  39.51 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.839867  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5241  AmiS/UreI transporter  32.91 
 
 		 196 aa  84.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5302  transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5698  transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5376  putative transporter  32.28 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0807737  hitchhiker  0.00638051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5573  putative transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5629  putative transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5144  transporter; acetamide transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5129  transporter; acetamide transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5543  putative transporter  32.28 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5581  transporter, putative  31.65 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2159  AmiS/UreI transporter  40.49 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0421  hypothetical protein  42.55 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3657  transporter  35.98 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3578  AmiS/UreI transporter  37.04 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3506  AmiS/UreI transporter  30.3 
 
 		 231 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>