21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0308 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0308  AmiS/UreI transporter  100 
 
 		 192 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0689938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0314  AmiS/UreI transporter  58.1 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1308  AmiS/UreI transporter  65.29 
 
 		 171 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.958044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3570  AmiS/UreI transporter  55.95 
 
 		 170 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2145  AmiS/UreI transporter  51.18 
 
 		 170 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0322  Urea transporter  40.59 
 
 		 171 aa  98.6  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000124071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1843  AmiS/UreI transporter  41.76 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.839867  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5241  AmiS/UreI transporter  33.54 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5581  transporter, putative  33.54 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5698  transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5144  transporter; acetamide transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5129  transporter; acetamide transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5302  transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5629  putative transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5573  putative transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5376  putative transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0807737  hitchhiker  0.00638051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5543  putative transporter  32.91 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2159  AmiS/UreI transporter  39.39 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0421  hypothetical protein  38.69 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3578  AmiS/UreI transporter  35.54 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3657  transporter  33.33 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>