22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0421 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0421  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2159  AmiS/UreI transporter  57.77 
 
 
252 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5241  AmiS/UreI transporter  43.71 
 
 
196 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5581  transporter, putative  42.51 
 
 
196 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5144  transporter; acetamide transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5698  transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5302  transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5543  putative transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5376  putative transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0807737  hitchhiker  0.00638051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5573  putative transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5629  putative transporter  42.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5129  transporter; acetamide transporter  41.92 
 
 
196 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3657  transporter  43.98 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3506  AmiS/UreI transporter  37.79 
 
 
231 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1308  AmiS/UreI transporter  40 
 
 
171 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.958044  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3578  AmiS/UreI transporter  34.95 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1843  AmiS/UreI transporter  39.52 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.839867  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2145  AmiS/UreI transporter  35.63 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3570  AmiS/UreI transporter  35.58 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0314  AmiS/UreI transporter  35.58 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0322  Urea transporter  36.9 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000124071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0308  AmiS/UreI transporter  38.69 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0689938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>