22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3578 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3578  AmiS/UreI transporter  100 
 
 
212 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3506  AmiS/UreI transporter  61.14 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2159  AmiS/UreI transporter  39.25 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5241  AmiS/UreI transporter  33.33 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5129  transporter; acetamide transporter  34.57 
 
 
196 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5144  transporter; acetamide transporter  34.57 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5543  putative transporter  34.57 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5376  putative transporter  34.57 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0807737  hitchhiker  0.00638051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5573  putative transporter  34.57 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5629  putative transporter  34.57 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5581  transporter, putative  34.04 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5698  transporter  34.04 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5302  transporter  34.04 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0421  hypothetical protein  34.95 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329244  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2145  AmiS/UreI transporter  37.04 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0322  Urea transporter  27.22 
 
 
171 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000124071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1843  AmiS/UreI transporter  37.11 
 
 
160 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.839867  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3657  transporter  31.74 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3570  AmiS/UreI transporter  33.94 
 
 
170 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1308  AmiS/UreI transporter  35.15 
 
 
171 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.958044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0314  AmiS/UreI transporter  32.73 
 
 
190 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0308  AmiS/UreI transporter  38.04 
 
 
192 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0689938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>