21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3506 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3506  AmiS/UreI transporter  100 
 
 
231 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3578  AmiS/UreI transporter  57.21 
 
 
212 aa  181  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2159  AmiS/UreI transporter  39.29 
 
 
252 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0421  hypothetical protein  37.79 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329244  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5241  AmiS/UreI transporter  31.43 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5581  transporter, putative  31.43 
 
 
196 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5129  transporter; acetamide transporter  31.43 
 
 
196 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5144  transporter; acetamide transporter  31.43 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5629  putative transporter  31.43 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5573  putative transporter  31.43 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5376  putative transporter  31.43 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0807737  hitchhiker  0.00638051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5543  putative transporter  31.43 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5698  transporter  30.86 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5302  transporter  30.86 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1843  AmiS/UreI transporter  29.41 
 
 
160 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.839867  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0322  Urea transporter  25.29 
 
 
171 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000124071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2145  AmiS/UreI transporter  30.3 
 
 
170 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0314  AmiS/UreI transporter  33.14 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3657  transporter  35.42 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3570  AmiS/UreI transporter  29.76 
 
 
170 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1308  AmiS/UreI transporter  29.41 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.958044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>