33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3176 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  296  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  64.15 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  64.19 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  43.67 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  49.06 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  47.13 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  45.59 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  34.15 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  37.04 
 
 		 190 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  38.89 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  32.47 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  44.25 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  38.27 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  35.9 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  41.07 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  37.72 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  36.67 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  36.67 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  34.21 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  28.39 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  36.67 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  30.6 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  36.13 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  33.73 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  34.62 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  33.99 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  33.54 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  29.49 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  30.2 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  35.79 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>