14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0530 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0530  toluene tolerance protein Ttg8  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4937  toluene tolerance protein  93.53 
 
 
224 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95159  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4809  hypothetical protein  94.03 
 
 
224 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4986  toluene tolerance protein Ttg8  93.68 
 
 
201 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66090  hypothetical protein  52.1 
 
 
216 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5733  hypothetical protein  50.9 
 
 
216 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4985  toluene tolerance protein, putative  45.51 
 
 
226 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0535  toluene tolerance protein, putative  47.85 
 
 
251 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  42.78 
 
 
620 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0762  toluene tolerance protein, putative  43.6 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.013011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44720  hypothetical protein  45.71 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  26.32 
 
 
457 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
499 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
457 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>