15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4231 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4231  outer membrane protein H1  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.91755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1185  outer membrane protein H1  97.01 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1215  outer membrane protein H1  96.52 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1197  outer membrane protein H1  94.03 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4241  outer membrane protein H1  59.7 
 
 		 201 aa  241  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  54.9 
 
 		 200 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2977  hypothetical protein  54.92 
 
 		 201 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  54.95 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  32.11 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  31.43 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3459  hypothetical protein  29.56 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  29.55 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3635  hypothetical protein  29.56 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>