40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2364 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 634 aa  1291    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.42 
 
 		 580 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  26.78 
 
 		 787 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1214  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.43 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6938  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1830  microbial collagenase  29.41 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000167843  normal  0.0782319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3415  microbial collagenase  29.41 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3772  serine protease, subtilase family  29.55 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000373923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3502  serine protease  29.21 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000122382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3514  serine protease  29.21 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3892  serine protease  29.21 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000928217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1437  serine protease, subtilase family  29.79 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000606827  hitchhiker  0.00102573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3605  serine protease  29.21 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1091  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.3 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3794  serine protease  28.42 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000410497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3861  serine protease, subtilase family  29.45 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5678  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0596714  decreased coverage  0.000827324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  25 
 
 		 307 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  25.36 
 
 		 297 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  24.86 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 		 298 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.77 
 
 		 462 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.77 
 
 		 703 aa  53.9  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.35 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.61 
 
 		 320 aa  51.2  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.61 
 
 		 320 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  25.74 
 
 		 298 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.61 
 
 		 320 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  24.2 
 
 		 315 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0714  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 		 683 aa  47.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.11 
 
 		 771 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  25.27 
 
 		 315 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.26 
 
 		 627 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  25.27 
 
 		 316 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.84 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1610  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.44 
 
 		 707 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2968  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 		 704 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.877299  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 295 aa  44.3  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  33.33 
 
 		 485 aa  44.3  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.16 
 
 		 410 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>