13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1736 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  42.8 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  61.54 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  44.66 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2396  hypothetical protein  38.39 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0659  hypothetical protein  28.68 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1874  hypothetical protein  31.53 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  32.77 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1835  hypothetical protein  29.36 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116087 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1435  hypothetical protein  30.15 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1130  hypothetical protein  31.82 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.3984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04096  flavodoxin  30.65 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>