13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1285 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62186  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1687  hypothetical protein  94.19 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4032  hypothetical protein  93.02 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  64.2 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0491  hypothetical protein  51.72 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  63.51 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2978  hypothetical protein  56.41 
 
 		 40 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  36.14 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  42.37 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  35.56 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>