14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1185 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2369  C-5 cytosine-specific DNA methylase  68.12 
 
 		 596 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  69.41 
 
 		 636 aa  839    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0270809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1185  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 559 aa  1143    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256863  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1720  C-5 cytosine-specific DNA methylase  84.76 
 
 		 434 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000451649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2352  C-5 cytosine-specific DNA methylase  66.13 
 
 		 559 aa  741    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0658  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.54 
 
 		 648 aa  611  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2937  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.41 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1717  C-5 cytosine-specific DNA methylase  91.2 
 
 		 135 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1093  C-5 cytosine-specific DNA methylase  65.66 
 
 		 107 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00117815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1573  C-5 cytosine-specific DNA methylase  65.66 
 
 		 107 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00203711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2452  hypothetical protein  46.81 
 
 		 177 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000760235  unclonable  0.000000000305739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  22.73 
 
 		 344 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 		 366 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>