15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0558 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  299  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  93.33 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  89.33 
 
 		 150 aa  235  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  88 
 
 		 194 aa  223  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  66.67 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  60.67 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  71.96 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  54.29 
 
 		 156 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  56.25 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  52.83 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  46.94 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  29.03 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  28.23 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  28.23 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>