14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1005 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  100 
 
 		 351 aa  733    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  41.28 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  40.7 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  40.41 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  40.41 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  37.68 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  40.35 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  39.04 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  38.95 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  36.11 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  30.36 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  27.3 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  23.86 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  26.94 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>