14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1003 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1003  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  43.07 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  44.63 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  27.66 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  26.38 
 
 		 329 aa  92.4  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  25.64 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  27.27 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  28 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  26.82 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  24.35 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  23.48 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  28.71 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>