27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2376 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  164  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  48.75 
 
 
91 aa  94  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  46.25 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  44.74 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  48.61 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  44.87 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  45.83 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  41.25 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  47.95 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  42.67 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  41.89 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  38.16 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  34.21 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  37.18 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.02 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  31.51 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  28.74 
 
 
89 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1650  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  30.26 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  36.23 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  28.57 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  37.68 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  29.33 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  31.58 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>