14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0175 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0175  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  331  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00679863  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0189  hypothetical protein  68.1 
 
 
162 aa  216  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0156086  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  29.9 
 
 
265 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  27.08 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  28.15 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  28.15 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  27.07 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>