15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3322 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3322  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3525  anti-repressor protein Ant  57.14 
 
 
189 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860875  hitchhiker  0.000134642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1530  anti-repressor protein Ant  54.29 
 
 
189 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1775  anti-repressor protein Ant  54.29 
 
 
189 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271275  normal  0.0239228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2253  anti-repressor protein Ant  54.29 
 
 
189 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000406549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3142  anti-repressor protein Ant  54.29 
 
 
189 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.682869  hitchhiker  0.00000000668139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2424  anti-repressor protein Ant  45.31 
 
 
315 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  40 
 
 
334 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1718  hypothetical protein  41.59 
 
 
316 aa  94.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000662496  unclonable  0.0000000124796 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0847  hypothetical protein  25.23 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000160526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0815  hypothetical protein  27.62 
 
 
206 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2871  hypothetical protein  27.62 
 
 
206 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000371637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5403  hypothetical protein  30.85 
 
 
273 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.286654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1739  hypothetical protein  31 
 
 
277 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.326437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2796  hypothetical protein  29.7 
 
 
277 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>