27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3727 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3727  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
120 aa  251  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71299  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.63 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119666 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04357  glyoxalase family protein  54.62 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000718  hypothetical protein  55 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06603  lactoylglutathione lyase  52.1 
 
 
121 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0561  hypothetical protein  47.06 
 
 
122 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1608  hypothetical protein  51.9 
 
 
80 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000377163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2084  hypothetical protein  40.68 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1671  hypothetical protein  39.83 
 
 
124 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1450  hypothetical protein  35.04 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2123  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.93 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01187  Lactoylglutathione lyase 2396  31.3 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  34.78 
 
 
267 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03509  bleomycin resistance protein  30.83 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1612  hypothetical protein  27.5 
 
 
235 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0293267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1609  hypothetical protein  52.78 
 
 
37 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000295369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0490  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03858  bleomycin resistance protein  47.06 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.352337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2493  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000450738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4303  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.477386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295231  normal  0.713495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3720  bleomycin resistance protein  25.23 
 
 
126 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>