22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2991 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  100 
 
 		 136 aa  268  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  60.29 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  63.77 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  62.32 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36840  hypothetical protein  77.04 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.693285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  66.18 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  65.44 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  67.44 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1205  hypothetical protein  63.97 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  31.73 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  34.91 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1898  hypothetical protein  36.51 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0912  membrane protein  31 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  31.78 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  32.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  31.36 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  25.23 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  32.46 
 
 		 145 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  29.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  24.78 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>