13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2977 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2977  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  70.05 
 
 		 200 aa  287  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  70.05 
 
 		 200 aa  287  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4241  outer membrane protein H1  58.71 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4231  outer membrane protein H1  54.92 
 
 		 201 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.91755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1197  outer membrane protein H1  54.92 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1185  outer membrane protein H1  54.4 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1215  outer membrane protein H1  54.4 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  32.26 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  29.03 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  31.44 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>