30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2894 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2894  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11111  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  51.16 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  48.1 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0970  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  45.68 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2481  oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  41.77 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  39.08 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3195  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  42.35 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.66 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  41.46 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  36.71 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.24 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0201  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  36.47 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.41736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.24 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.27 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.27 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.27 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  36.71 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0638  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  34.18 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.471241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1320  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  34.48 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219843  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1024  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  31.18 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3069  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  30.95 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0084  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  41.56 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000518126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3337  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  37.8 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1219  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  34.52 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  37.8 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1065  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  34.94 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2987  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  32.5 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1739  sodium pump decarboxylase gamma subunit  29.07 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.301356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3651  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  41.54 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1198  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  37.04 
 
 		 81 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0495339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>