24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2024 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2024  patatin  100 
 
 		 631 aa  1271    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2994  Patatin  33.1 
 
 		 666 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  32.82 
 
 		 685 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  33.04 
 
 		 624 aa  214  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1993  putative suppressor  32.07 
 
 		 630 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3069  hypothetical protein  33.04 
 
 		 782 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1013  hypothetical protein  35.99 
 
 		 782 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5875  Patatin  33.03 
 
 		 646 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0531  hypothetical protein  53.04 
 
 		 605 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0560  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  48.78 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0563  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  49.59 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  42.68 
 
 		 332 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  41.1 
 
 		 341 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  32.99 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  32.56 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  28.48 
 
 		 294 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  32.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  32.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  32.56 
 
 		 321 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  32.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  32.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  32.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  32.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  32.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>