35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1120 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  100 
 
 
688 aa  1386    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  40.99 
 
 
707 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  36.24 
 
 
712 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  47.99 
 
 
888 aa  399  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  45.08 
 
 
891 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  38.34 
 
 
857 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  28.93 
 
 
702 aa  289  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  25.27 
 
 
854 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  25.27 
 
 
847 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  33.91 
 
 
1307 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  27.46 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  34 
 
 
882 aa  80.5  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  30.23 
 
 
860 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  29.05 
 
 
1100 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  26.67 
 
 
863 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  30.61 
 
 
1205 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  31.33 
 
 
1104 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  29.81 
 
 
1086 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  29.81 
 
 
1154 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  28.75 
 
 
1066 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  29.81 
 
 
1148 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  29.81 
 
 
1120 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  29.81 
 
 
1164 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  28.75 
 
 
1068 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  28.75 
 
 
1070 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  29.19 
 
 
1108 aa  65.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  30.07 
 
 
1134 aa  65.1  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  28.97 
 
 
1058 aa  62.4  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  30.36 
 
 
1222 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  25.77 
 
 
700 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  29.46 
 
 
673 aa  60.5  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  30.47 
 
 
633 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  23.23 
 
 
863 aa  54.3  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  22.93 
 
 
863 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  20.22 
 
 
904 aa  43.9  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>