32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2630 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2630  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 1645 aa  3359    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2341  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1513 aa  144  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0224053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2782  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 		 1625 aa  141  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3852  Pyrrolo-quinoline quinone  23.26 
 
 		 1630 aa  52  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.1 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.1 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 		 454 aa  50.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.7 
 
 		 392 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.61 
 
 		 393 aa  50.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.61 
 
 		 393 aa  50.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.61 
 
 		 393 aa  50.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.7 
 
 		 392 aa  50.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.4 
 
 		 393 aa  49.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.73 
 
 		 431 aa  49.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 		 463 aa  48.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  47.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  47.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.02 
 
 		 393 aa  47.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 392 aa  47.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  22.91 
 
 		 422 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.51 
 
 		 392 aa  47  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.7 
 
 		 392 aa  45.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.27 
 
 		 448 aa  45.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 393 aa  45.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.09 
 
 		 557 aa  45.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.48 
 
 		 426 aa  45.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>