33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2407 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 		 342 aa  704    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  27.65 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  37.7 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.46 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.91 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.48 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.37 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.21 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  36.93 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.6 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.28 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.21 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.4 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  32.13 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1784  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.03 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3080  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  36.5 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  35.69 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  30.23 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.51 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.56 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.12 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.3 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.84 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.39 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6006  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  33.67 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0652  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  27.63 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  33.92 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.48 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  24.5 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  23.38 
 
 		 288 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.9 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  23.32 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2336  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.57 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0290582  normal  0.194172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>