22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2050 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2050  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  31.88 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2449 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  27.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  46.43 
 
 		 77 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 78 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1154  preprotein translocase, SecG subunit  29.03 
 
 		 97 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  31.03 
 
 		 118 aa  44.7  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  35.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  26.47 
 
 		 123 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  32.76 
 
 		 1088 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0812  preprotein translocase, SecG subunit  34.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.184287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  43.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  32.98 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  41.56 
 
 		 81 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  38.82 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 117 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  31.82 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  32.2 
 
 		 107 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  45.68 
 
 		 80 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  26.55 
 
 		 111 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>