18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1834 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1834  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 483 aa  972    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4099  hypothetical protein  26.33 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0513  hypothetical protein  25.7 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1161  hypothetical protein  32.52 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 		 238 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 		 239 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  33.91 
 
 		 235 aa  47.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 		 240 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.63 
 
 		 250 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 		 238 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 		 243 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 243 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  30.1 
 
 		 242 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>