20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1040 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1040  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 1122 aa  2308    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1039  hypothetical protein  52.53 
 
 		 328 aa  360  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0607  hypothetical protein  27.81 
 
 		 270 aa  61.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3895  hypothetical protein  26.09 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 262 aa  52.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5439  hypothetical protein  26.74 
 
 		 293 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 283 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  33.03 
 
 		 271 aa  48.9  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 525 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 314 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 714 aa  47.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 329 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  31.18 
 
 		 265 aa  47.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.73 
 
 		 310 aa  47.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  25.35 
 
 		 310 aa  47.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 996 aa  46.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  33.01 
 
 		 271 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  22.58 
 
 		 316 aa  45.8  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 738 aa  45.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>