20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0125 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0125  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
161 aa  335  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2523  metal-dependent hydrolase  28.86 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00251032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3068  metal-dependent hydrolase  29.51 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1075  metal-dependent hydrolase  26.97 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0128131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0463  hypothetical protein  27.56 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3488  hypothetical protein  25.79 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  26.73 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2164  hypothetical protein  28.32 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4437  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4718  hypothetical protein  26.45 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.841461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2476  metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 
173 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000196121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2729  metal-dependent hydrolase  25.34 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000144697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4996  metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00599507  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2719  metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2589  metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0454538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2443  metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2714  metal-dependent hydrolase  23.45 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000896185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2766  metal-dependent hydrolase  23.45 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.603683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2700  metal-dependent hydrolase  23.45 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2515  metal-dependent hydrolase  23.45 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0719464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>