9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2001 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  828    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0538  hypothetical protein  43.12 
 
 		 412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003707  hypothetical protein  43.8 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.294697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1654  hypothetical protein  39.8 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0675  hypothetical protein  40.94 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652653  normal  0.969104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1323  hypothetical protein  38.67 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  21.16 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  25.87 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  26.09 
 
 		 602 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>