37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0902 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  893    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  56.67 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  54.61 
 
 		 446 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  57.55 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  55.32 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  60.36 
 
 		 386 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  54.85 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  53.9 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  57.4 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  56.81 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  54.46 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  55.24 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  56.42 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  57.14 
 
 		 380 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  52.25 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  56.09 
 
 		 421 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  52.72 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  54.22 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  53.6 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  55.99 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  54 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  54 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  52.46 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  56.37 
 
 		 370 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  51.9 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  49.88 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  51.35 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  50.48 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  49.25 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  53.76 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  49.49 
 
 		 458 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  33.67 
 
 		 453 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  44.04 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  41.55 
 
 		 690 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  40.44 
 
 		 509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  56.34 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  32.74 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>