10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0257 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3049  hypothetical protein  49.21 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2611  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000880483  normal  0.526898 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5162  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105605  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2369  hypothetical protein  27.17 
 
 		 241 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3262  hypothetical protein  28.78 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2339  hypothetical protein  26.59 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143796  unclonable  0.000000136454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1271  hypothetical protein  26.59 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6751  hypothetical protein  26.39 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1830  hypothetical protein  24.71 
 
 		 241 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>