More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1691 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  88.91 
 
 		 434 aa  775    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  89.86 
 
 		 434 aa  792    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  100 
 
 		 434 aa  867    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  68.52 
 
 		 448 aa  607  9.999999999999999e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  63.33 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  62.47 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  59.85 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.34 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  45.84 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.87 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.14 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  50.88 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.56 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  48.52 
 
 		 390 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.23 
 
 		 407 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  53.37 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  47.17 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.31 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  46.82 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  48.21 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  47.52 
 
 		 387 aa  345  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  46.31 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.53 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  46.06 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.72 
 
 		 489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  45.45 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  47.83 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  45.8 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  45.8 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  47.83 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  44.02 
 
 		 390 aa  340  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  47.55 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  47.67 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.05 
 
 		 503 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.67 
 
 		 467 aa  335  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  46.98 
 
 		 493 aa  335  7.999999999999999e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  47.84 
 
 		 394 aa  332  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  44.08 
 
 		 756 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  44.08 
 
 		 756 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.9 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  46.82 
 
 		 412 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.65 
 
 		 414 aa  332  9e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  46.06 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  44.08 
 
 		 756 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  47.95 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  47.4 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  46.23 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  46.06 
 
 		 412 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  43.65 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  43.65 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.01 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  45.8 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  45.8 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.55 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.81 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  43 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  43.62 
 
 		 756 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  45.16 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  45.9 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  43.39 
 
 		 773 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  45.9 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  42.82 
 
 		 489 aa  325  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.98 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  42.92 
 
 		 756 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  43.39 
 
 		 756 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  43.39 
 
 		 761 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  43.39 
 
 		 760 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  43.39 
 
 		 760 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  44.47 
 
 		 415 aa  322  6e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.48 
 
 		 481 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  43.2 
 
 		 759 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  45.16 
 
 		 463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  47.55 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.22 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  43.82 
 
 		 764 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  42.6 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  45.7 
 
 		 463 aa  319  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.48 
 
 		 405 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.36 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  42.33 
 
 		 769 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  43.2 
 
 		 759 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  42.96 
 
 		 759 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  42.72 
 
 		 759 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  46.3 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>