16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2665 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2665  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00833902  hitchhiker  0.00279656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  56.72 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  55.56 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  35.82 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  54.29 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  33.9 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  52.78 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  52.78 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  36 
 
 		 134 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  47.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  53.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  47.22 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  44.44 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  47.22 
 
 		 131 aa  40  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  47.22 
 
 		 131 aa  40  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  33.33 
 
 		 141 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>