17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1577 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1577  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
491 aa  1018    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.443791  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1411  FAD dependent oxidoreductase  55.77 
 
 
490 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3907  FAD dependent oxidoreductase  52.74 
 
 
491 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134239  normal  0.273927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0260  hypothetical protein  50 
 
 
495 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05798  oxidoreductase  49.36 
 
 
477 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1919  hypothetical protein  47.13 
 
 
524 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.478195  hitchhiker  0.00137011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2210  FAD dependent oxidoreductase  46.44 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0334587 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0719  hypothetical protein  47.69 
 
 
477 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000137883  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0595  putative exported oxidoreductase  48.67 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000165  hypothetical protein  48.51 
 
 
479 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303978  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1895  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 
579 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05208  hypothetical protein  30.28 
 
 
311 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0185066 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0243  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1955  hypothetical protein  27.65 
 
 
460 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  27.14 
 
 
997 aa  47.4  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  46.51 
 
 
304 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>