17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05798 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000165  hypothetical protein  80.92 
 
 
479 aa  801    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05798  oxidoreductase  100 
 
 
477 aa  993    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0719  hypothetical protein  59.65 
 
 
477 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000137883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0260  hypothetical protein  52.3 
 
 
495 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3907  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 
491 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134239  normal  0.273927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1411  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 
490 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1577  FAD dependent oxidoreductase  48.79 
 
 
491 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.443791  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2210  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 
535 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0334587 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1919  hypothetical protein  45.86 
 
 
524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.478195  hitchhiker  0.00137011 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0595  putative exported oxidoreductase  49.33 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1895  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
579 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05208  hypothetical protein  26.6 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0185066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0243  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 
460 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1955  hypothetical protein  22.64 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  37.84 
 
 
527 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
1139 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>