19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0453 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 273 aa  550  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  48.54 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  41.45 
 
 		 275 aa  221  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  35.71 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  34.51 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  36.11 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  31.46 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30 
 
 		 445 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  30.86 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  26.87 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  31.27 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  30.5 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.86 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  24.74 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  28.62 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  28.62 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  29.29 
 
 		 642 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  26.24 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>