33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3892 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3892  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0560  hypothetical protein  51.37 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.343341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0901  hypothetical protein  48.63 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2604  hypothetical protein  48.63 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2465  hypothetical protein  48.63 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50.35 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.37 
 
 
151 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3639  hypothetical protein  40.24 
 
 
164 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176214  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.25 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2550  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.82 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4405  hypothetical protein  37.34 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.105181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4924  hypothetical protein  37.34 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0696  hypothetical protein  37.97 
 
 
164 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.71 
 
 
164 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4981  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.71 
 
 
164 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348147  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3386  hypothetical protein  36.71 
 
 
164 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1119  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.96 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.41 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1839  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  27.89 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.85 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3868  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.15 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0853747  normal  0.686212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4479  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 
146 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0247  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2068  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.34 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0242  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.8 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.14 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.54 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.912588  normal  0.440605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3512  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.43 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2847  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.45 
 
 
152 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000365676  normal  0.0147483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
317 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
317 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4724  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.65 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>