43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3758 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  100 
 
 
340 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  81.05 
 
 
343 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  80.17 
 
 
343 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  62.06 
 
 
353 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  63.02 
 
 
357 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  61.18 
 
 
353 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  61.18 
 
 
353 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  61.18 
 
 
353 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  61.18 
 
 
353 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  63.99 
 
 
355 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  63.34 
 
 
335 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  63.34 
 
 
335 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  60.77 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  60.77 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  60.77 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  60.45 
 
 
359 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  60.45 
 
 
359 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  60.45 
 
 
359 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  56.41 
 
 
357 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  55.24 
 
 
358 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  58.06 
 
 
371 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  58.06 
 
 
371 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  57.74 
 
 
381 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  51.37 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  49.11 
 
 
349 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  52.58 
 
 
346 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  45.86 
 
 
370 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  45.82 
 
 
345 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  41.42 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  39.6 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  42.19 
 
 
406 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.638652 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  40.18 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  35.03 
 
 
356 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  33.43 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  30.43 
 
 
356 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  31.23 
 
 
575 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  31.8 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  30.72 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  31.82 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0849  purine or other phosphorylase family 1  31.13 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0917  Purine nucleoside permease-like protein  30.25 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155546  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0774  phosphorylase, putative  30.25 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2814  purine nucleoside permease  26.22 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>