More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2422 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2422  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6662  Glutathione S-transferase domain  61.9 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2348  glutathione S-transferase-like protein  63.81 
 
 
210 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626345  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1606  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321137  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4303  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.08 
 
 
211 aa  232  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2577  glutathione S-transferase domain protein  53.77 
 
 
214 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0373373  normal  0.54871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2535  glutathione S-transferase domain protein  53.77 
 
 
214 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000323926  normal  0.67324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2698  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.77 
 
 
214 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0163547  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2589  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.77 
 
 
214 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0104002  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2489  glutathione S-transferase domain protein  53.3 
 
 
214 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000237468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2850  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.83 
 
 
226 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00070742  normal  0.4259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02226  predicted enzyme  52.88 
 
 
214 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1351  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.88 
 
 
214 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2677  glutathione S-transferase domain protein  52.88 
 
 
214 aa  202  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000495147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02186  hypothetical protein  52.88 
 
 
214 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1355  Glutathione S-transferase domain protein  52.4 
 
 
214 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000448516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2451  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.4 
 
 
214 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2595  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.4 
 
 
214 aa  201  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000722661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2457  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.4 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000408424  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3441  glutathione S-transferase domain protein  52.4 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3482  glutathione S-transferase domain protein  48.79 
 
 
213 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3546  Glutathione S-transferase domain protein  48.31 
 
 
213 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3399  glutathione S-transferase-like protein  47.57 
 
 
225 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3464  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.77 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.774951  normal  0.0546262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  28.78 
 
 
229 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  30.19 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  31.73 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  30.43 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  28.29 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  32.11 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  28.23 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.56 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  31.28 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.52 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  28.44 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.04 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  30.69 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  29.86 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  30.77 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  32.16 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  32.16 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  24.04 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  32.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  28.74 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.56 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  26.56 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  31.18 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  24.02 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  29.27 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  29.74 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  29.74 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  32.09 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  28.5 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  31.02 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  30.61 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.05 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  29.59 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  29.41 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  26.63 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  26.09 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.76 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  29.44 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  29.32 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  29.94 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>