19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3806 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3806  NmrA family protein  100 
 
 
309 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3617  NmrA family protein  88.35 
 
 
309 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  53.16 
 
 
315 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1803  isoflavone reductase  53.87 
 
 
309 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1802  isoflavone reductase  53.85 
 
 
309 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  0.0109972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1864  isoflavone reductase  53.51 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1654  isoflavone reductase  53.85 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0467519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1472  isoflavone reductase  53.85 
 
 
309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  53.16 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  49.35 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  48.5 
 
 
313 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  47.9 
 
 
317 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  48.53 
 
 
317 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  47.91 
 
 
317 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  48.21 
 
 
317 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  37.7 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  27.9 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  23.49 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  24.86 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>