28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0469 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  42.18 
 
 		 899 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  42.62 
 
 		 899 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  49.62 
 
 		 910 aa  836    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  71.17 
 
 		 881 aa  1260    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  100 
 
 		 888 aa  1818    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  41.01 
 
 		 893 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  49.07 
 
 		 820 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  47.1 
 
 		 815 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  44.68 
 
 		 832 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  43.12 
 
 		 844 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  44.16 
 
 		 846 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  29.74 
 
 		 901 aa  330  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  30.17 
 
 		 878 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  30.07 
 
 		 892 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  28.51 
 
 		 862 aa  294  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  32.25 
 
 		 890 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  40.18 
 
 		 679 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  39.94 
 
 		 674 aa  231  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  27.36 
 
 		 835 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  33.33 
 
 		 743 aa  187  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  24.24 
 
 		 938 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  46.11 
 
 		 185 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  28.64 
 
 		 714 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  28.64 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  26.94 
 
 		 726 aa  142  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  28.41 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  28.41 
 
 		 714 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  28.41 
 
 		 714 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>