17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4947 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4947  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3345  hypothetical protein  93.85 
 
 		 65 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0623  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.16233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2374  hypothetical protein  46.15 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.34259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1102  protein of unknown function DUF1127  49.21 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0963  hypothetical protein  48.89 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0557  hypothetical protein  57.78 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2209  hypothetical protein  57.78 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677439  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1229  hypothetical protein  55.56 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2848  hypothetical protein  68.97 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0216  hypothetical protein  48.89 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  61.76 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  53.85 
 
 		 50 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  53.85 
 
 		 43 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  55.26 
 
 		 50 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  55.26 
 
 		 50 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  58.33 
 
 		 50 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>