15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4163 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4163  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2280  hypothetical protein  31.78 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0529  hypothetical protein  31.5 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05580  hypothetical protein  30.57 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0606  hypothetical protein  23.61 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4978  hypothetical protein  26.55 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5027  hypothetical protein  26.55 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4851  hypothetical protein  27.68 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0599931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0487  hypothetical protein  26.29 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1691  hypothetical protein  25.84 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0956962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1972  hypothetical protein  22.69 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1229  hypothetical protein  24.47 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000235297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0560  hypothetical protein  27.37 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294179  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1627  hypothetical protein  28.23 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.197704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4090  hypothetical protein  27.42 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>