275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3359 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  95.24 
 
 		 153 aa  287  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  65.52 
 
 		 173 aa  193  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  65.28 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  63.45 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  63.45 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  59.44 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  53.79 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  56.62 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  48.95 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  48.95 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  48.95 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  48.95 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  47.55 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  47.55 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  47.48 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  46.76 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  46.04 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.326397  normal  0.640285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  42.45 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  52.67 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  44.06 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1722  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00703201  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2628  GCN5-related N-acetyltransferase  41.78 
 
 		 278 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 		 143 aa  116  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.22282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3024  acetyltransferase  39.58 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3747  GCN5-related N-acetyltransferase  43.07 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 		 164 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 		 168 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  43.17 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  40.6 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4020  acetyltransferase, GNAT family  36.5 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  37.76 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0595  acetyltransferase  32.8 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2721  GCN5-related N-acetyltransferase  42.03 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  33.83 
 
 		 196 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2972  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0451042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2287  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0469  acetyltransferase  34.78 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0240937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4609  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000167629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  35.42 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1199  acetyltransferase  30.07 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  34.48 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  31.47 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 		 291 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  32.82 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.06 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  32.2 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  28.33 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  27.84 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  27.84 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3075  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882795  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  30.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  27.84 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  27.92 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03351  hypothetical protein  27.5 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03400  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  27.5 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3975  hypothetical protein  27.5 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>