18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0580 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  44 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0680  hypothetical protein  52.83 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.0280363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  47.17 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  47.17 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  56.41 
 
 		 124 aa  47.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  66.67 
 
 		 48 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  58.82 
 
 		 48 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  44.68 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  55.88 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  60 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  52.94 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  60.61 
 
 		 48 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  60.61 
 
 		 48 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  63.33 
 
 		 48 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  55.88 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  44.9 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>